I personaggi principali dello spettacolo, Zack e Cody Martin, sono fratelli gemelli noti per il loro comportamento dispettoso e il disprezzo per l'autorità. Tuttavia, man mano che la serie avanza, iniziano a sviluppare un maggiore senso di rispetto e deferenza verso i loro coetanei, insegnanti e genitori.
Un esempio di deferenza nello show è la relazione di Zack e Cody con il capitano della loro nave, il signor Moseby. Inizialmente, Zack e Cody disobbediscono costantemente alle regole del signor Moseby e si mettono nei guai. Tuttavia, man mano che la serie va avanti, iniziano a rendersi conto che il signor Moseby non è solo un severo disciplinare, ma anche un adulto premuroso e responsabile che si prende cura dei loro migliori interessi. Di conseguenza, Zack e Cody iniziano a mostrare più rispetto e deferenza nei confronti del signor Moseby, e alla fine diventano amici intimi.
Un altro esempio di deferenza nello show è la relazione di Cody con suo fratello maggiore, Zack. Zack è spesso il gemello più dominante ed estroverso, mentre Cody è più timido e riservato. Tuttavia, man mano che la serie va avanti, Cody inizia a sviluppare un più forte senso di fiducia in se stesso e assertività. Inizia a farsi valere ed esprimere le sue opinioni, anche se differiscono da quelle di Zack. Di conseguenza, Zack inizia a mostrare più rispetto e deferenza nei confronti di Cody, e alla fine diventano fratelli più stretti.
Nel complesso, il tema della deferenza è importante in The Suite Life of Zack &Cody on Deck. Mostra come i personaggi imparano a rispettarsi e ad apprezzarsi a vicenda, e come questo porta a relazioni più forti e ad un ambiente di vita più armonioso.