Durante la guerra, Yahiko, Nagato e Konan furono testimoni degli orrori della guerra e decisero che un giorno avrebbero creato un mondo senza guerra e dolore. Formarono l'Akatsuki, un'organizzazione dedita a raggiungere la pace con ogni mezzo necessario.
Inizialmente, l'Akatsuki era una piccola organizzazione che si concentrava sull'aiuto di piccoli villaggi e paesi colpiti dalla guerra. Tuttavia, man mano che l'organizzazione cresceva in potere e influenza, iniziò ad attirare l'attenzione dei villaggi ninja più grandi. I villaggi iniziarono a vedere l'Organizzazione Alba come una minaccia e iniziarono ad agire contro l'organizzazione.
Come risultato della pressione dei villaggi, l'Organizzazione Alba iniziò a cambiare. Divenne più militarizzato e cominciò a concentrarsi sull’ottenimento del potere piuttosto che sul raggiungimento della pace. L'organizzazione iniziò a reclutare criminali di grado S e i suoi metodi divennero sempre più spietati.
Alla fine, l'Organizzazione Alba fu sconfitta da Naruto Uzumaki e dai suoi amici, e i suoi membri furono sparsi in tutto il mondo. Tuttavia, l’eredità dell’Organizzazione Alba continua a vivere e rimane un simbolo dei pericoli dell’estremismo.