Il calcedonio è la forma più comune di quarzo criptocristallino. Il termine 'criptocristallino' significa che i cristalli che compongono il minerale sono così piccoli da non essere riconoscibili ad occhio nudo, né con un normale microscopio. Quando è presente come aggregato criptocristallino in forma fibrosa diventa la pietra preziosa conosciuta come crisoprasio.
Il termine Calcedonio viene utilizzato in due casi specifici:il primo, per uno specifico tipo di struttura microcristallina caratterizzata da strati fibrosi alternati di quarzo criptocristallino; in secondo luogo, più in generale, per descrivere una gamma di pietre preziose che si adattano a questa descrizione, comprese varietà traslucide come agata, corniola, crisoprasio, diaspro e onice, nonché alcuni esemplari opachi.