Nel campo della matematica:
- "De superficium curvis" (Sulle superfici curve)
- "De triangulis sphaericis" (Sui triangoli sferici)
Nel campo dell'ottica:
- "Observationes opticae" (Osservazioni ottiche)
Nel campo della meccanica:
- "De planis inclinatis" (Sui piani inclinati)
Nel campo dell'astronomia:
- "Theoricae planetarum" (Teorie dei Pianeti)
- "Stellarum fixarum positiones" (Posizioni delle Stelle Fisse)
Nel campo dell'idrostatica:
- "De sphaerae superficiei mensura" (Sulla misurazione della superficie della sfera)
Nel campo dell'architettura:
- "Dichiarazione della fabbrica di S. Maria del Fiore" (Spiegazione della Struttura della Cattedrale di Santa Maria del Fiore)
Nel campo dell'ingegneria militare:
- "Dell'architettura militare"
È importante notare che questo elenco potrebbe non includere ogni singola opera di Comandini, poiché scrisse ampiamente su vari argomenti ed era considerato un poliedrico durante il suo tempo.