Metodi di ricerca utilizzare sia l'etnografia che la trascrizione e l'analisi musicale e includere lavoro sul campo e interviste con informatori. Alcuni etnomusicologi eseguono anche la musica che stanno studiando, mentre altri si concentrano maggiormente sull'analisi e sull'interpretazione.
Lavoro sul campo permette agli etnomusicologi di immergersi nella musica e nella cultura delle persone che stanno studiando, permettendo loro di acquisire una profonda comprensione del ruolo che la musica gioca nelle loro vite.
Poiché le culture e le pratiche musicali sono in costante cambiamento, gli etnomusicologi spesso raccolgono registrazioni audio e video, trascrivono e analizzano esecuzioni musicali, creano strumenti musicali, compongono e arrangiano musica e documentano i risultati delle loro ricerche in libri, articoli e altre pubblicazioni.