1. Fuga dalla signorina Hannigan: Annie riesce a scappare dalle grinfie di Miss Hannigan, la crudele direttrice dell'orfanotrofio, con l'aiuto dei suoi nuovi amici.
2. Rivelazione del segreto di papà Warbucks: Annie scopre la verità su Daddy Warbucks, il ricco uomo d'affari che diventa il suo tutore, quando rivela di essere stato lui a inviare le lettere di "Papà" all'orfanotrofio.
3. Adozione: Annie viene ufficialmente adottata da papà Warbucks durante una commovente cerimonia, circondata dai suoi amici dell'orfanotrofio, e insieme diventano una famiglia amorevole.
4. Vittoria politica: Daddy Warbucks usa la sua influenza e ricchezza per sostenere la campagna per la rielezione del presidente Franklin D. Roosevelt, ottenendo una vittoria che solleva il morale della nazione durante la Grande Depressione.
5. Per sempre felici e contenti: Il musical si conclude con Annie e Daddy Warbucks che vivono felici e contenti nella loro grande villa, insieme al loro nuovo compagno canino, Sandy, e agli orfani che hanno anche trovato casa.
6. Finale: La scena finale mostra Annie e le sue amiche che esprimono la loro gioia e ottimismo riguardo al futuro mentre cantano la canzone edificante, "Tomorrow", mentre camminano mano nella mano.