Assassinio sull'Orient Express approfondisce il tema dell'identità e le sue complessità. Il romanzo presenta diversi personaggi con background, culture e obiettivi diversi, ognuno dei quali nasconde un'identità nascosta o porta con sé segreti. Poirot, il detective, deve guardare oltre la superficie per determinare i veri caratteri e le motivazioni dei passeggeri.
Anche il tema della giustizia gioca un ruolo significativo nella storia. Poirot cerca non solo di risolvere il crimine ma anche di garantire che venga fatta giustizia. I passeggeri si trovano ad affrontare un dilemma etico quando si riuniscono per decidere il destino dell'assassino. Devono decidere se seguire rigorose procedure legali o prendere in mano la situazione per raggiungere un senso di giustizia che ritengono necessario.
Il romanzo solleva domande intriganti sulla complessità dell'identità umana, sull'ambiguità della moralità e sulla ricerca della verità e dell'equità.