La boutique è stata progettata dall'amico e collaboratore artistico dei Beatles, Simon Posthuma, che ha anche disegnato le copertine degli album e altro materiale promozionale. Doveva essere un punto vendita al dettaglio di merce relativa ai Beatles e ad altri artisti associati alla Apple Records, inclusi abbigliamento, accessori e articoli per la casa.
Il negozio era noto per il suo arredamento colorato e psichedelico, che rifletteva l'estetica della fine degli anni '60. Presentava anche articoli disegnati dagli stessi Beatles, come magliette, sciarpe e gioielli.
Tuttavia, la boutique Apple ha dovuto affrontare sfide fin dall'inizio, tra cui la mancanza di esperienza gestionale, una cattiva gestione finanziaria e la concorrenza di altri negozi. I Beatles incontrarono anche difficoltà con l'affitto della proprietà e disaccordi tra loro e i loro consulenti sulla direzione del negozio.
Di conseguenza, la Boutique Apple chiuse nell'agosto del 1968 dopo solo un anno di attività. I Beatles subirono perdite finanziarie significative a causa dell'impresa e la chiusura del negozio segnò la fine del loro coinvolgimento diretto nell'attività di vendita al dettaglio.