Finale 1:Il leggendario duo (partner:Pikachu)
* Partner: Pikachu
* Scelta della battaglia finale: Accetta l'offerta per diventare il nuovo duo leggendario
Questo finale mostra te e Pikachu che diventate il nuovo duo leggendario, incaricato di proteggere il mondo dall'oscurità. È un lieto fine, ma significa anche una pesante responsabilità e un impegno continuo nella vita di una squadra di soccorso.
Fine 2:Il viaggio della squadra di soccorso continua (partner:qualsiasi altro Pokémon)
* Partner: Qualsiasi Pokémon diverso da Pikachu
* Scelta della battaglia finale: Rifiuta l'offerta per diventare il nuovo duo leggendario
Questo finale si concentra sulla continua avventura della tua squadra di soccorso, sottolineando il forte legame della squadra e la loro continua dedizione nell'aiutare gli altri. Mostra che tu e il tuo partner continuate ad aiutare i Pokémon bisognosi ed esplorare il mondo insieme.
Nota importante:
* È importante notare che la scelta di diventare la coppia leggendaria è disponibile solo quando si gioca con Pikachu come partner.
* Sebbene ogni partner abbia dialoghi e personalità unici, l'arco narrativo generale e le scelte all'interno del gioco rimangono gli stessi indipendentemente dal partner scelto.
Indipendentemente dal finale che ottieni, entrambi questi finali mostrano il viaggio appagante e significativo di una squadra di salvataggio di Pokemon Mystery Dungeon, evidenziando i temi dell'amicizia, del lavoro di squadra e del sacrificio di sé.