Lascia il gruppo alla fine della saga di Johto (intorno alla fine dell'anime Pokemon Oro e Argento) e non riappare fino all'inizio della saga di Sinnoh (intorno all'inizio dell'anime Pokemon Diamante e Perla).
Anche se ci sono alcuni casi in cui Misty appare nell'anime di Hoenn in flashback o menzioni, non visita mai fisicamente la regione nella trama principale.