L'opera più importante di Gysi è stato il suo libro, _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908), in cui descriveva i suoi studi sull'anatomia e sulla funzione dell'articolazione temporo-mandibolare. Ha inoltre sviluppato diversi strumenti e tecniche per misurare l'occlusione e l'articolazione, incluso l'articolatore Gysi Simplex .
Il lavoro di Gysi ha avuto un profondo impatto sullo sviluppo dell'odontoiatria ed è considerato uno dei padri dell'occlusione e dell'articolazione moderne.
Ecco un elenco di alcune delle opere più importanti di Alfred Gysi:
* _Anatomie der Kaumuskulatur_ (1897)
* _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908)
* _Il problema dell'articolazione_ (1910)
* _Un libro di testo di odontoiatria protesica_ (1915)
* _Studi sull'articolazione mandibolare_ (1929)
* _Der Kauapparat des Menschen_ (1940)
Il lavoro di Gysi è stato tradotto in molte lingue e ha ricevuto numerosi premi e riconoscimenti per i suoi contributi all'odontoiatria. È considerato una delle figure più importanti della storia dell'odontoiatria.