Bethge nacque a Barmen, in Germania, nel 1909. Studiò teologia alle università di Bonn e Berlino. Dopo la laurea, ha servito come viceparroco in una chiesa a Berlino. Nel 1935 fu nominato segretario di Dietrich Bonhoeffer, allora parroco della Friedenskirche a Berlino-Dahlem.
Bethge lavorò con Bonhoeffer fino al 1944, quando Bonhoeffer fu arrestato dalla Gestapo. Anche Bethge è stato arrestato, ma è stato successivamente rilasciato. Dopo la guerra Bethge lavorò come teologa e scrittrice. Fu autore di numerosi libri su Bonhoeffer e la sua teologia.
Nel 1972, Bethge fu co-destinataria insieme ad altri due ex segretari di Bonhoeffer del Premio Nobel per la Pace. Il premio è stato assegnato per la diffusione della raccolta di opere di Bonhoeffer.
Bethge morì a Berlino nel 2000. Aveva 91 anni.