Il padre di Bruno viene promosso comandante di Auschwitz e la famiglia si trasferisce nel campo di concentramento. Bruno è confuso e turbato dai cambiamenti avvenuti nella sua vita. Non capisce perché deve lasciare i suoi amici e la sua casa alle spalle, e non capisce cosa sta succedendo alle persone nel campo di concentramento.
Bruno incontra Shmuel.
Un giorno, Bruno sta esplorando il terreno del campo di concentramento quando vede un ragazzino dall'altra parte della recinzione. Il ragazzo indossa un pigiama a righe e sembra molto triste. Bruno inizia a parlare con il ragazzo e diventano amici. Shmuel racconta a Bruno della sua vita nel campo di concentramento e Bruno inizia a comprendere gli orrori di ciò che sta accadendo.
Bruno si intrufola nel campo di concentramento.
Un giorno Bruno decide di intrufolarsi nel campo di concentramento per visitare Shmuel. Si mette un paio di pigiami a righe e sgattaiola attraverso la recinzione. Bruno trova Shmuel e trascorrono la giornata insieme. Giocano, parlano e ridono. Bruno si rende conto che anche nei momenti più bui c'è ancora speranza.
Bruno e Shmuel vengono uccisi.
Il giorno successivo Bruno e Shmuel vengono catturati dai nazisti. Vengono portati in una stanza e gli viene fatta un'iniezione letale. Bruno e Shmuel muoiono insieme e i loro corpi vengono bruciati nel crematorio.
Il ragazzo con il pigiama a righe è una storia potente e commovente sull'Olocausto. È una storia sull’amicizia, l’innocenza e il potere della speranza.