* Washington, D.C., USA: Il quartier generale dello spettacolo della CIA è stato girato in Virginia, in particolare nell'area di Alessandria.
* Europa: Varie città europee sono servite da sedi, tra cui Parigi, Francia; Berlino, Germania; Vienna, Austria; e Praga, Repubblica ceca.
* Asia: Le scene sono state girate in luoghi come Hong Kong, Cina; Tokyo, Giappone; e Bangkok, Thailandia.
* Africa: Lo spettacolo ha anche girato in varie parti dell'Africa, tra cui Marocco e Sudafrica.
* Sud America: Alcune riprese si sono svolte in Colombia, in particolare nella città di Medellin.
La produzione dello spettacolo ha utilizzato entrambe le località reali e set di studio per creare il suo aspetto distinto. Le riprese di "Covert Affairs" hanno spesso comportato una vasta pianificazione di viaggi e logistici, consentendo allo spettacolo di offrire agli spettatori di intravedere varie località globali.