Dopo che i loro genitori muoiono in un misterioso incendio, i bambini vengono affidati alle cure del loro lontano e sinistro parente, il conte Olaf. Olaf, un cattivo astuto e malvagio, insegue incessantemente l'enorme fortuna degli orfani, complottando e complottando per metterci sopra le mani. Si traveste e usa vari schemi per rapire, mettere in pericolo e manipolare i bambini Baudelaire.
La serie segue il viaggio straziante degli orfani mentre cercano di sfuggire alle grinfie di Olaf e scoprire i segreti della morte dei loro genitori. Affrontano un flusso costante di situazioni pericolose, dall'essere bloccati su un'isola con un serpente velenoso alla convivenza con un gruppo di attori teatrali ingannevoli quanto Olaf.
Nel corso delle loro avventure, Violet usa la sua mente creativa per creare gadget e soluzioni, Klaus utilizza la sua vasta conoscenza della lettura per risolvere enigmi e decifrare indizi e Sunny, nonostante la sua età, è una bambina fiera e intelligente che comunica attraverso un linguaggio infantile unico.
La serie è narrata da Lemony Snicket, un autore che tenta di mettere in guardia i lettori sugli sfortunati eventi che si verificano, sottolineando l'importanza della speranza e della resilienza anche di fronte alla tragedia.
Il mistero generale della morte dei genitori Baudelaire è intrecciato in tutta la serie, con indizi e false piste sparse lungo il percorso. La serie esplora i temi della perdita, della resilienza, della famiglia e dell'importanza di combattere l'ingiustizia.
Nonostante l'argomento oscuro, la serie è intrisa di umorismo e arguzia, rendendola divertente e stimolante. Sfida i giovani lettori ad affrontare le complessità della vita e a trovare speranza anche nelle situazioni più buie.