Il fagotto è uno strumento a fiato ad ancia doppia, mentre il flauto è uno strumento a fiato suonato soffiando aria attraverso un foro. L'imboccatura (posizionamento delle labbra) e il flusso d'aria necessari per suonare il fagotto sono molto diversi da quelli richiesti per suonare il flauto, quindi imparare a suonare il fagotto non sarà più facile per qualcuno che ha già imparato a suonare il flauto. In effetti, potrebbe essere anche più difficile, poiché il fagotto è generalmente considerato uno strumento più impegnativo da imparare rispetto al flauto.