La canzone inizia con Gerard che canta della forza e della resilienza di sua madre, descrivendo come ha cresciuto lui e suo fratello Mikey da sola dopo il divorzio dei genitori. La ringrazia per il suo amore e sostegno incondizionati e per avergli insegnato a essere forte e indipendente.
Man mano che la canzone procede, Gerard parla dei suoi sentimenti di dolore e perdita dopo la morte di sua madre. Canta di quanto gli manca e di come avrebbe voluto passare più tempo con lei. Esprime anche il suo senso di colpa per non essere riuscito a salvarla dalla malattia.
Nonostante il dolore e la tristezza, la canzone alla fine celebra la vita e l'amore di Donna Lee Way. Gerard canta di come lei sarà sempre nel suo cuore e di come il suo spirito continuerà a guidarlo nella sua vita.
Il video musicale di "Mama" presenta home video e fotografie di Gerard e Mikey con la madre, oltre a filmati della loro infanzia. Fornisce una rappresentazione visiva dello stretto legame tra Gerard e Donna e aiuta a dare vita al testo della canzone.
Nel complesso, "Mama" è una canzone potente ed emozionante che esprime il profondo amore e l'ammirazione che Gerard Way aveva per sua madre. È una canzone sul dolore, sulla perdita e sul potere duraturo dell’amore.