È giocabile solo nel gioco a 16 bit Sonic &Knuckles , che è stato rilasciato come cartuccia separata. Potresti quindi inserire la cartuccia di Sonic &Knuckles sopra una cartuccia di Sonic the Hedgehog 3 per sbloccare la funzione "Lock-on" , permettendoti di giocare nei panni di Knuckles in una nuova versione del gioco.
Sebbene Knuckles non sia direttamente giocabile in Sonic 3, appare come un personaggio boss nel gioco.