È meglio pensarli come due diversi adattamenti dello stesso manga.
* Fullmetal Alchemist (2003) è il primo adattamento anime, che si discosta dal manga dopo un certo punto.
* Fullmetal Alchemist:Brotherhood (2009) è un adattamento più fedele dell'intero manga, raccontando una storia diversa rispetto alla versione del 2003.
Quindi dovresti iniziare con *Fullmetal Alchemist:Brotherhood* dell'episodio 1.