Alcune delle differenze chiave tra manga e anime includono:
* L'ordine degli eventi è diverso. Nel manga alcuni eventi accadono prima o dopo rispetto all'anime. Ad esempio, nel manga, Teito Klein incontra Frau nel primo capitolo, mentre nell'anime non si incontrano fino all'episodio 8.
* Alcuni caratteri sono diversi. Nel manga, ci sono alcuni personaggi che non compaiono nell'anime, e alcuni personaggi che appaiono nell'anime non compaiono nel manga. Ad esempio, il personaggio di Ceres non appare nel manga, mentre il personaggio di Mikage non appare nell'anime.
* Il finale è diverso. Il manga e l'anime hanno finali diversi. Nel manga, il viaggio di Teito Klein e Frau si conclude in modo diverso rispetto all'anime.
Nel complesso, il manga e l'anime 07-Ghost sono due interpretazioni distinte e separate della stessa storia. Sebbene condividano alcune somiglianze, ci sono anche molte differenze tra le due versioni.