I segnalini danno vengono posizionati sulla casella dei segnalini danno di un Pokémon, che si trova nell'angolo in basso a sinistra della carta. La casella dei segnalini danno può contenere fino a 10 segnalini danno e, quando è piena, il Pokémon viene messo KO.
I segnalini danno possono essere posizionati su un Pokémon da una varietà di attacchi. Alcuni attacchi infliggono una quantità specifica di danni, mentre altri infliggono danni in base alle statistiche del Pokémon attaccante. Ci sono anche alcuni attacchi che possono causare danni indiretti, ad esempio avvelenando o bruciando i Pokémon dell'avversario.
Quando un Pokémon viene messo KO, viene messo nella pila degli scarti. Il giocatore che ha messo KO il Pokémon pesca una carta Premio. Le carte premio possono essere utilizzate per potenziare i tuoi Pokémon o per pescare più carte dal tuo mazzo.
I segnalini danno sono una parte importante del Gioco di Carte Collezionabili Pokémon, poiché aiutano a tenere traccia dell'avanzamento del gioco e a determinare quali Pokémon sono ancora in gioco.