Prima di poter catturare Rayquaza, devi:
- Ottieni l'Ala d'Arcobaleno dal Monte Argento.
- Vai in cima al Pilastro del Cielo e inserisci l'Ala nell'Alter.
- Oltrepassa le nuvole che sembrano terreno solido e sali in cima alla cascata per affrontare Rayquaza.