Nello specifico, gli viene somministrato un potente farmaco sperimentale chiamato APTX 4869 da un membro della Black Organization di nome Gin .
Gin ha ingannato Shinichi facendogli prendere il farmaco mentre indagava sulle attività dell'organizzazione. Il farmaco doveva essere un veleno letale, ma si è ritorto contro, facendo rimpicciolire Shinichi.