Cos'è l'indice di Jacobsen?

L'indice di Jacobsen di un albero filogenetico è una misura della sua ramificazione, o del grado in cui l'albero contiene brevi rami interni. È definita come il rapporto tra la lunghezza totale dell'albero (la somma delle lunghezze di tutti i rami dell'albero) e la lunghezza minima possibile dell'albero, che è la lunghezza di un albero con lo stesso numero di taxa e senza rami interni ( tutti i taxa sono collegati direttamente alla radice).

Un indice di Jacobsen alto indica un albero con molti rami interni corti, che possono essere il risultato di una rapida irradiazione dei taxa o di un alto tasso di evoluzione del carattere. Un indice di Jacobsen basso indica un albero con pochi rami interni corti, che può essere il risultato di una lenta radiazione dei taxa o di un basso tasso di evoluzione del carattere.

L'indice di Jacobsen viene spesso utilizzato per confrontare la ramificazione relativa di diversi alberi filogenetici e può essere utilizzato per valutare l'adattamento di diversi modelli evolutivi a un dato set di dati.