Gli scritti di Pizzecolli possono essere riassunti in quattro categorie generali:
Commentari su edifici e monumenti antichi, soprattutto quelli dell'antica Roma, ma comprendenti anche rovine greche e romane nelle province sia occidentali che orientali.
Resoconti dei suoi viaggi. Molti dei suoi resoconti di viaggio sono intrecciati con descrizioni di antichità. I suoi itinerari di viaggio possono essere seguiti attraverso il Peloponneso, Creta, Rodi e il Levante, fino all'Egitto, e risalendo il Nilo fino a Tebe. In Grecia, compì la prima ascesa documentata sulla cima del Monte Olimpo.
Epistole e invettive contro l'incuria e la distruzione dei monumenti antichi. Uno dei primi appelli europei per la conservazione dell’architettura.
Epigrammi ed epitaffi in versi. Alcuni di questi sono incisi su antichi edifici e opere d'arte da lui osservate.
Molti dei suoi scritti furono pubblicati già nel XVI secolo, e il suo resoconto del Peloponneso (Peloponnesiaca), pubblicato nel XVII secolo, è ora considerato il principale valore storico dell'opera. Gran parte del suo lavoro rimane in forma manoscritta.