- Mangia, bevi e sii sano:Guida all'alimentazione sana della Harvard Medical School (2001)
- Epidemiologia nutrizionale, 3a edizione (2013) (co-curato con Meir Stampfer)
- Epidemiologia nutrizionale di Willett, seconda edizione (2018) (a cura di Willett)
- The Salt Sugar Fat Fix:How the Food Giants Hooked Us (2020) (scritto in collaborazione con Marion Nestlé)
Oltre a questi libri, Walter Willett ha pubblicato articoli scientifici, recensioni e raccomandazioni politiche in varie riviste mediche e nutrizionali.