Gli altri suoi romanzi includono:
* Il ciclo della Porta della Morte (1990-1994)
* Il Libro della Terra Nera (1995)
* Il libro della rosa bianca (1996)
* Il libro del sole rosso (1997)
* Il vuoto (2000)
* La Sfera (2001)
* L'orizzonte (2002)
* Il velo (2003)
* La divisione (2005)
* L'Anello (2007)
* Il Muro (2008)
I suoi racconti includono:
* "L'ultimo dei Winnebago" (1987)
* "La forma delle cose" (1989)
* "La luna del cacciatore" (1991)
* "L'ombra della tempesta" (1992)
* "Il pozzo delle tenebre" (1993)
* "Il destino di Dragonstar" (1994)
* "Il destino degli dei" (1995)
* "La fine dell'eternità" (1996)
* "Il giorno in cui la Terra si fermò" (1997)
* "L'ultima domanda" (1998)
Le sue collezioni includono:
* *William E. Waters:In bilico* (1991)
* *William E. Waters:L'ultimo dei Winnebago e altre storie* (1993)
* *William E. Waters:La forma delle cose e altre storie* (1995)
* *William E. Waters:La luna del cacciatore e altre storie* (1997)
* *William E. Waters:L'ombra della tempesta e altre storie* (1999)
Waters ha anche scritto diversi libri per giovani adulti, tra cui:
* Le terre perdute (2000-2003)
* L'ombra degli dei (2005)
* L'ultimo degli elfi (2007)
* L'ascesa del Signore Oscuro (2009)
* La battaglia dei Titani (2011)
* L'alba degli antichi (2013)
* La caduta di Atlantide (2015)
Waters ha vinto numerosi premi per il suo lavoro, incluso il World Fantasy Award per il miglior romanzo per Ira di Tiamat e il Locus Award per il Miglior romanzo fantasy per Il frammento di cristallo . È membro della Science Fiction and Fantasy Writers of America e della Horror Writers Association.