Man mano che la storia procede, Fiona scopre che la sua vera bellezza non risiede nel suo aspetto fisico ma nella sua gentilezza, amore e qualità interiori. Sceglie di rimanere nella sua forma di orco, abbracciando il suo vero sé indipendentemente dalle norme sociali. Anche il pregiudizio iniziale di Shrek nei confronti degli umani e degli orchi viene messo in discussione, dimostrando che la vera bellezza va oltre gli attributi fisici e le nozioni preconcette.
Il film rafforza il messaggio che la bellezza interiore e la capacità di amare ed essere amati contano più della bellezza fisica superficiale. La relazione tra Shrek e Fiona sottolinea questa idea poiché trovano amore e accettazione nonostante le loro differenze fisiche.