Apparizioni cinematografiche:
- "Spectre" (2015) nel ruolo di Marco Sciarra
- "I magnifici sette" (2016) nel ruolo di Nate Love
- "L'esperimento Belko" (2016) nel ruolo di Mike Milch
- "The Limehouse Golem" (2016) nel ruolo dell'ispettore Kildare
- "La ragazza del treno" (2016) nel ruolo del Dr. Kamal Abdic
- "Una cura per il benessere" (2017) nel ruolo di Enrique
- "Jumanji:Benvenuti nella giungla" (2017) nel ruolo del Professor Sheldon Oberon
- "Tomb Raider" (2018) nel ruolo di Lu Ren
- "Pacific Rim:La rivolta" (2018) nel ruolo di Caleb Loomis
- "Black Adam" (2022) nel ruolo di Ishmael
Apparizioni televisive:
- "The Following" (2013) nel ruolo di Theo Noble
- "True Detective" (2014) nel ruolo di Ginger
- "Narcos" (2015) nel ruolo di Javier Peña
- "Il figlio" (2017) nel ruolo di Eli McCullough
- "Westworld" (2018-2020) nel ruolo di Hector Escaton
- "The Boys" (2019-2022) nel ruolo di Eagle l'arciere
- "The Terminal List" (2022) nel ruolo di Ben Edwards
- "Il Vecchio" (2022) nel ruolo di Raymond Waters
Oltre alla recitazione, Juan Root ha anche diretto diversi cortometraggi ed episodi di serie televisive, come "The Son" e "The Terror".