- Medaglia Newbery per la narrativa nel 2005 per The Spiderwick Chronicles
- Premio Eisner come miglior scrittore/artista nel 2006 per The Coldest Girl in Coldtown
- Premio Edgar per il miglior giovane adulto nel 2011 per White Cat
- Premio Nebula per la migliore novella nel 2012 per "La ragazza che beveva la luna"
- Premio World Fantasy per il miglior romanzo nel 2019 per Il principe crudele