- Medaglia Garvan-Olin dell'American Chemical Society (1983):questo prestigioso premio riconosce risultati eccezionali nel campo della chimica.
- La Medaglia Tolman della Sezione della California Meridionale dell'American Chemical Society (1985):questo premio viene assegnato a un individuo che ha dato un contributo significativo al campo della chimica.
- Premio Fellows dell'American Association for the Advancement of Science (AAAS) (1987):questo premio viene conferito a individui che hanno dato contributi eccezionali al progresso della scienza.
- Premio Donna dell'anno della National Organization for Women (NOW) (1990):questo premio riconosce il contributo significativo delle donne in vari campi.
- Premi L'Oréal-UNESCO For Women in Science (2005):Marie Daly è stata una delle cinque destinatarie di questo premio, che riconosce i risultati eccezionali ottenuti dalle donne nella ricerca scientifica.
- La Medaglia Nazionale della Scienza (2005):questa è una delle più alte onorificenze conferite agli scienziati negli Stati Uniti, riconoscendo i loro eccezionali contributi nel campo.
I risultati e l'impatto di Marie M. Daly nel campo della chimica sono stati ampiamente riconosciuti e celebrati, e i suoi premi servono come testimonianza dei suoi risultati e contributi eccezionali.