Film:
* Fenicotteri rosa (1972): Waters ha interpretato il ruolo del "Divino" in questo film cult.
* Vita disperata (1977): È apparso anche come "The Divine" in questo film.
* Poliestere (1981): Waters ha interpretato il ruolo di "The Divine" e ha anche diretto questo film.
* Lacca per capelli (1988): Waters ha avuto un cameo come commesso di un negozio di dischi in questo film.
* Cry-Baby (1990): Ha fatto una breve apparizione come preside della scuola.
* Mamma seriale (1994): Waters ha interpretato il ruolo di "The Divine" in questo film.
* Pecker (1998): È apparso di nuovo come "The Divine" in questo film.
* Una sporca vergogna (2004): Waters ha interpretato il ruolo di "The Divine" in questo film.
* Questo mondo sporco (2006): È apparso in questo documentario sulla sua vita e il suo lavoro.
* Stazione Fruitvale (2013): Waters ha fatto un'apparizione cameo come giornalista.
* La casa costruita da Jack (2018): Waters ha avuto un piccolo ruolo in questo film di Lars von Trier.
Televisione:
* I Simpson (1991): Waters si è espresso nell'episodio "Homer Defined".
* South Park (1997): Ha anche doppiato se stesso nell'episodio "Chef Aid".
* I Soprano (2001): Waters ha avuto un cameo come regista nell'episodio "The Blue Comet".
* Sviluppo arrestato (2003): Ha avuto un piccolo ruolo nell'episodio "L'Immacolata Elezione".
* Lo spettacolo di Larry Sanders (1992-1998): Waters ha fatto alcune apparizioni nei panni di se stesso in questo spettacolo.
* Ugly Betty (2006-2010): È apparso come se stesso nell'episodio "Ugly Betty's World".
* RuPaul's Drag Race (2010-oggi): Waters ha fatto numerose apparizioni come giudice ospite in questo show.
Sebbene le sue apparizioni in altri progetti siano limitate, John Waters è famoso soprattutto per i suoi film unici e influenti.